Tra i due altari, nella stessa parete, si scorgono i resti della decorazione murale antica della chiesa, costituiti da una "Maddalena" sotto una edicola e da un lacerto di una crocifissione, databili alla fine dei XIV secolo.

La cappella a destra dell'altare maggiore conserva un tondo marmoreo scolpito a rilievo e raffigura

no. L'esecuzione del rilievo, fornito di una splendida cornice lignea decorata con festone vegetale, spetta a Benedetto da Maiano (1442-1447), ed è databile agli anni 1491-93 circa. Si tratta di un'opera che si fa apprezzare per le sue raffinate ed eleganti linee, unite ad una accurata attenzione per il dettaglio descrittivo, caratteristiche che si ritrovano nell'arte di questo importante scultore ed architetto fiorentino della seconda metà del Quattrocento. Nella cappella a sinistra è visibile uno splendido crocifisso ligneo ispirato a quello eseguito da Michelangelo per la chiesa fiorentina di Santo Spirito e attribuito a Jacopo Sansovino (1486-1570), importante protagonista dei Cinquecento italiano ed al quale sembra effettivamente riferirsi la classica ed equilibrata figura del Cristo Crocifisso, realizzata con un modellato morbidissimo e delicato.

Nella stessa cappella è possibile anche osservare un bel tabernacolo marmoreo per la conservazione della Eucarestia. Il manufatto è composto di un grembiule in basso, all'interno dei quale si vede lo stemma dei donatore, che però non è stato identificato. Il prospetto presenta una volta a botte prospettica con la porticina affiancata da due angeli. Il coronamento è costituito da una lunetta al centro della quale si trova la colomba dello Spirito Santo.

Questo notevolissimo manufatto, che aveva in passato fatto pronunciare i nomi di Mino da Fiesole ed, addirittura, di Donatello, è stato riferito più convincentemente allo scultore fiorentino Domenico Rosselli, intorno alla metà dei XV secolo (Pieraccini, p. Cit, p. 34).

E' da segnalare, sul primo altare a sinistra, una tela raffigurante la "Crocifissione con i Santi Carlo Borromeo, Francesco d'Assisi, Giovanni evangelista e la Vergine", eseguita da Matteo Rosselli nel 1617 per Antonio Puccini , interessante e ben riuscito esempio di pittura devozionale e controriformata dei primi del XVII secolo. L'altare successivo mostra una "Annunciazione", attribuita al pittore fiorentino Giovanni Balducci detto il Coscia (c. 1560 post. 1631), che realizza un'opera vaporosa dotata di colori chiari ed algidi, memori dei modi della prima grande pittura manieristica fiorentina e di Giovanni Battista Naldini, maestro del Coscia.

Sulla parete opposta, quella destra, si possono ammirare una "Natività della Madonna,, compiuta da Matteo Rosselli intorno agli anni 1633-35 (Faini, p. 98, n. 188). Nella solenne opera il pittore raffigura i Santi Jacopo e Filippo che presentano un grande dipinto con la Nascita della Vergine, e realizza così un curioso dipinto nel dipinto